В кадры фотоловушек, установленных на территории Чаткальского государственного биосферного заповедника сотрудниками Министерства экологии, охраны окружающей среды и изменения климата, попали редкие животные.
Среди них волки, заяц-толай, горностай, сибирские горные козлы, лисица, тетеревятник, темнобрюхий улар (гималайский) и туркестанская рысь, последняя из которых занесена в Красную Книгу Узбекистана в статусе уязвимого и сокращающегося подвида.
В целом фауна Чаткальского заповедника содержит 65 видов животных, которые находятся под защитой государства.